ศักยภาพด้านการบริหารงานวิจัยเกี่ยวกับการบริหารจัดการงานวิจัยนั้น สิ่งที่สำคัญคือ ระบบและกลไกการบริหารงานวิจัย แต่สภาพปัญหาของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี คืองานวิจัยส่วนใหญ่เป็นงานวิจัยตามสาขาวิชาที่ผู้วิจัยมีความสนใจ ขาดความร่วมมือจากสหวิทยาการในการแก้ปัญหาสำคัญร่วมกัน ขาดความเชื่อมโยงกับกลไกและนโยบายที่เกี่ยวข้อง และที่สำคัญผู้ใช้ประโยชน์จากงานวิจัยยังไม่มีส่วนในการกำหนดโจทย์วิจัย การมีส่วนร่วมในกระบวนการวิจัย การมีส่วนร่วมในกระบวนการแลกเปลี่ยนเรียนรู้กับผู้เกี่ยวข้อง การดำเนินงานยังขาดการพัฒนาระบบบริหารจัดการคุณภาพ (Quality Management System) โดยใช้หลักการ แนวคิด ทฤษฎีเกี่ยวกับการบริหารจัดการมาประยุกต์ใช้เพื่อให้เกิดกลไกในการขับเคลื่อนอย่างต่อเนื่องยั่งยืนและมีระบบประกันคุณภาพอย่างเป็นวัฒนธรรมองค์กรโดยความร่วมมือของทุกฝ่าย จึงมีการกำหนดระบบและกลไกในการดำเนินงานของหน่วยจัดการงานวิจัยและพันธกิจสัมพันธ์ของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีดังนี้
หน่วยจัดการงานวิจัยและพันธกิจสัมพันธ์ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี เชื่อว่างานวิจัยที่มีคุณภาพและสามารถนำไปใช้ประโยชน์ได้นั้น จำเป็นต้องมีการบริหารจัดการงานวิจัยที่มีประสิทธิภาพและประสิทธิผลเริ่มตั้งแต่การพัฒนาโจทย์วิจัยและข้อเสนอโครงการวิจัยให้ชัดเจน การติดตามสนับสนุนการดำเนินงานวิจัยให้ประสบความสำเร็จและการเผยแพร่สู่ระบบและกลไกที่สามารถนำผลการวิจัยไปใช้และขยายผลได้ คณะกรรมการหน่วยจัดการงานวิจัยและพันธกิจสัมพันธ์ คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีปีการศึกษา2559ได้ปรับปรุงระบบและกลไก จึงได้สร้างระบบและกลไกการบริหารงานวิจัย ดังนี้
1. ระบบพัฒนาโจทย์วิจัยบูรณาการเพื่อท้องถิ่น
2. ระบบพัฒนาข้อเสนอโครงการวิจัย
3. ระบบพัฒนานักวิจัย
4. ระบบการเผยแพร่ผลงานวิจัย
5. ระบบติดตามและสนับสนุนการวิจัย
6. ระบบบูรณาการงานวิจัยกับพื้นที่
7. ระบบและกลไกการคุ้มครองสิทธิ์ และทรัพย์สินทางปัญญา
8. ระบบการให้บริการด้านงานวิจัยและบริการวิชาการ
9. ระบบการพัฒนาสมรรถนะและยกย่องนักวิจัย